MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 chromosome

Total Repeats: 6022

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013416	A	6	6	1196492	1196497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_013416	CTTGC	5	25	1196502	1196526	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3503	NC_013416	CTAAA	2	10	1196527	1196536	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3504	NC_013416	GCAA	2	8	1196545	1196552	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3505	NC_013416	GGA	2	6	1196582	1196587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_013416	ATA	2	6	1199031	1199036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_013416	AAT	2	6	1199037	1199042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_013416	GTG	2	6	1199079	1199084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_013416	TAC	2	6	1199093	1199098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_013416	TTTC	2	8	1199118	1199125	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3511	NC_013416	ATT	2	6	1199130	1199135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_013416	T	6	6	1199222	1199227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_013416	CAG	2	6	1199282	1199287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_013416	TTAA	2	8	1199297	1199304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_013416	ATT	2	6	1199317	1199322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_013416	A	7	7	1199331	1199337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_013416	GTA	2	6	1200023	1200028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_013416	TTA	2	6	1200076	1200081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_013416	TGC	2	6	1200112	1200117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_013416	A	7	7	1200128	1200134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_013416	GGT	2	6	1200143	1200148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_013416	ACA	2	6	1200194	1200199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_013416	AAACGT	2	12	1200200	1200211	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3524	NC_013416	TTAGTA	2	12	1200248	1200259	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_013416	ACGT	2	8	1200289	1200296	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3526	NC_013416	A	6	6	1200706	1200711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_013416	TCA	2	6	1200870	1200875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_013416	AAT	2	6	1200878	1200883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_013416	TGA	2	6	1200891	1200896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_013416	AT	3	6	1200897	1200902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_013416	CAA	2	6	1200921	1200926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_013416	TTG	2	6	1200990	1200995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_013416	ATA	2	6	1201003	1201008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_013416	TGT	2	6	1201020	1201025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_013416	ATA	2	6	1201079	1201084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_013416	CCG	2	6	1201130	1201135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3537	NC_013416	ATC	2	6	1201177	1201182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_013416	TAT	2	6	1201253	1201258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_013416	GGA	2	6	1201291	1201296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_013416	TA	3	6	1201298	1201303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_013416	AGG	2	6	1201318	1201323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_013416	CATT	2	8	1201398	1201405	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3543	NC_013416	ATT	2	6	1201431	1201436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_013416	TCG	2	6	1201443	1201448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_013416	AAAT	2	8	1201449	1201456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_013416	TCG	2	6	1201530	1201535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_013416	GAAAAA	2	12	1201670	1201681	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_013416	ATT	2	6	1201763	1201768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_013416	A	6	6	1201783	1201788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_013416	A	9	9	1201804	1201812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_013416	T	6	6	1201841	1201846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_013416	TAA	2	6	1201865	1201870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_013416	T	7	7	1201931	1201937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_013416	ATT	2	6	1202157	1202162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_013416	TTA	2	6	1202163	1202168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_013416	TAT	2	6	1202171	1202176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_013416	TAATA	2	10	1203747	1203756	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3559	NC_013416	T	6	6	1204668	1204673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_013416	TA	3	6	1206567	1206572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3563	NC_013416	TA	3	6	1207913	1207918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_013416	T	6	6	1207963	1207968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_013416	CAT	2	6	1210270	1210275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3567	NC_013416	A	6	6	1212476	1212481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_013416	CG	3	6	1213463	1213468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3569	NC_013416	TTG	2	6	1213481	1213486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3571	NC_013416	ATT	2	6	1215123	1215128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_013416	GC	3	6	1215160	1215165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3573	NC_013416	TTA	2	6	1215568	1215573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3579	NC_013416	GCTT	2	8	1216123	1216130	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3580	NC_013416	GTTTT	2	10	1216166	1216175	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_013416	AT	3	6	1216196	1216201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_013416	TCT	2	6	1216216	1216221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3584	NC_013416	ATT	2	6	1216275	1216280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3588	NC_013416	AATGT	2	10	1217369	1217378	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_013416	T	8	8	1217423	1217430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3593	NC_013416	TAAA	2	8	1217558	1217565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_013416	ATTT	2	8	1217591	1217598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3599	NC_013416	ATT	2	6	1217822	1217827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_013416	ATA	2	6	1218150	1218155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_013416	GCA	2	6	1218174	1218179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_013416	CAA	2	6	1218196	1218201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_013416	ACA	2	6	1218206	1218211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_013416	ACA	2	6	1218231	1218236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_013416	A	6	6	1218302	1218307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_013416	T	6	6	1218343	1218348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_013416	T	8	8	1218368	1218375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_013416	T	6	6	1218398	1218403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_013416	T	6	6	1218652	1218657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_013416	CGA	2	6	1218678	1218683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3612	NC_013416	CACT	2	8	1220318	1220325	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3613	NC_013416	A	6	6	1220440	1220445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_013416	GTT	2	6	1220532	1220537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_013416	T	6	6	1221919	1221924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_013416	T	6	6	1221928	1221933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_013416	TC	3	6	1225137	1225142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3619	NC_013416	ATT	2	6	1225188	1225193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_013416	ATT	2	6	1225214	1225219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_013416	ATTT	2	8	1225260	1225267	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_013416	CAA	2	6	1225268	1225273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_013416	T	7	7	1225325	1225331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_013416	GTT	2	6	1227553	1227558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_013416	CTA	2	6	1227572	1227577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_013416	TAA	2	6	1227585	1227590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_013416	TGT	3	9	1227611	1227619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_013416	GAT	2	6	1233743	1233748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_013416	TAT	2	6	1233752	1233757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_013416	TAAAA	2	10	1233785	1233794	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_013416	TAT	2	6	1233800	1233805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3633	NC_013416	CAC	2	6	1233825	1233830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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